El territorio del municipio de Bácum estuvo ocupado desde mucho antes de la llegada de los españoles por los indios yaquis. El nombre de Bácum significa "lago" o "agua estancada", en la lengua yaqui. 


El pueblo de Bácum es uno de los ocho tradicionales pueblos de los yaquis y fue fundado en 1617 por los misioneros jesuitas Andrés Pérez de Rivas y Tomás Basilio, con el nombre de Santa Rosa de Bácum, y con la categoría de Pueblo de Misión teniendo como lugar de visita a Cócorit.


El municipio está ubicado en el sur del Estado de Sonora, su cabecera es la población de Bácum y se localiza en el paralelo 27° 32' de latitud norte y a los 110° 05' de longitud al oeste del meridiano de Greenwich; a una altura de 50 metros sobre el nivel del mar. 


Colinda con los siguientes municipios: al este con Cajeme, al oeste con Guaymas y su límite natural al sur es el Golfo de California.  
El Municipio posee una superficie de 1,409.7 km2, que representan el 0.76 por ciento del total estatal.



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